Не совсем понятно о чем речь, что в данном случае есть "старая версия" и "более новая"?
Например, если используется старая конфигурация "Бухгалтерия предприятия, редакция 2.0" (которую кстати снимают с поддержки) и вы хотите перейти на новую версию редакции 3.0 и конфигурация типовая без доработок, то перейти с 2.0 на 3.0 можно без проблем - делается это стандартным обновлением конфигурации (см.рис.).

Если же речь о том, что у вас есть какая-то старая конфигурация, которая сейчас работает на старой платформе 1С:Предприятие 8.2, а сейчас хотите ее перенести на платформу 1С:Предприятие 8.3, то это уже совсем другая история. Если конфигурация типовая, то скорее всего проблем не возникнет. Если же конфигурация доработанная или это вообще "самописка" разработанная "с нуля", то все будет зависеть от того, как дорабатывали. Скорее всего при запуске в режиме совместимости со старой версии платформы проблем не возникнет, но надо проверять.

В любом случае перед всеми манипуляциями сделайте резервную копию базы.