У YouTube есть возможность оставлять в комментариях временные метки для видео. Просто пишем в комментарии время в формате hh:mm:ss и YouTube сам превратит это в ссылку. Небезызвестный музыкальный сервис SoundCloud позволяет показывать комментарии к трэкам прямо на таймлайне. Так почему бы не сделать такое же в YouTube?!