Система управления базами данных (СУБД) в CRM Битрикс24, как и другие СУБД, не защищена от неожиданной остановки сервиса. Это может как вызвать сбой в работе самого сервиса, так и повлиять на дальнейшую целостность и работоспособность баз и отдельно взятых таблиц.
А что делать с пропущенными таблицами? и данными в них?
Если остался проект (например, площадка)
Можно пропущенные таблицы создать по инструкциям (SHOW CREATE TABLE)
По данным, если бэкап имеется - вливать уже из бэкапа