Трудностей нет вообще. ставишь приложение "Мой налог" и регистрируешь НПД. И всё, никаких геморроев с отчетностью, чеки в приложении, очень удобно. И налог, если работаешь с физиками меньше. Главный минус - на НПД фактически разрешены только услуги и продажа товаров которые произвел сам, чужое продавать нельзя. В общем посмотрите запрешенные виды деятельности, если ваша в список не входит, то скорее всего можно. Ещё на НПД не идет пенсионный стаж, так что если нет другой официальной работы, это минус. На ИП с другими системами налогообложения стаж идет.
думайте, существенно ли это для вас. Просто многие по молодости говорят: "мне этот стаж не нужен, все равно не доживу", ближе к пенсии мнение может измениться, а стажа нет(((.
Зарегистрировав переход на НПД, ИП автоматом отказался от УСН, так что все нормально. Никто не придерется, это законно. Есть другой минус в НПД: одно мое юрлицо работает с самозанятыми, налоговая достала проверками. Другое, с трудоустроенными работниками и ИП - и оно никому не интересно.
Если торгуете товаром, который не сделали лично, а где то взяли для перепродажи, то налоговая, при выяснении этого обстоятельства, должна пересчитать вам все доходы, по общей системе. Либо как физику без НПД, если торгуете на НПД без ИП.