Вообще странное решение.
Документооборот должен быть в надлежащем виде.

Суд работает на основании фактов. Факты в коммерческих спорах подтверждаются документами. Подписанных. С большой королевской синей печатью.
Есть контракт.
Есть платеж, есть выписка с банковского счета.
Работа выполнена и принята, значит есть оформленный и подписанный акт.

В ватсап можно бросить рыбы для того, что бы контрагент ознакомился, но это не означает принятие и согласие обеими сторонами с сутью этого документа.

"1 - Прописать в договоре возможность использования мессенджеров для деловой переписки"

Это крайне глупая и опасная идея. Открывает просто гигантские возможности для различного вида разводов.

2, 3
разумно

4 - Нотариальное удостоверение деловой переписки

Как истец докажет , что общался с ответчиком, а не с лесным эльфом?
Переписка может служить дополнительным доказательством ненадлежащего поведения или безответственности, но точно не той базой на чем стоит строить свой иск.

П.с. почитал я постановление.
Основанием послужила не переписка в ват.сап, а два факта.

1. То, что заказчик клал болт на требование к предоставлению отчетов продолжительное время.
2. Что не привел фактов, что работа не выполнена надлежащим образом и фактически использовал предоставленный код. (Можно предположить, что кто-то крайне криво написал ТЗ и по сути предъявить за косяки было нечего)

п.с. с стороны ответчика можно было бы попробовать зайти с стороны нотариального заверения истцом рабочего чата. По сути истец предоставил допуск третьим лицам к переписке, которая почти наверняка представляет из себя коммерческую тайну.