Партнёр налоговой практики, юридическая фирма "Гареев, Махно и Касьян"
Статус самозанятого связан со статусом "гражданина". То есть резидентство тут не влияет и вся эта история не применима.
См. Письмо Минфина № 03-11-11/2644 от 20.01.2020:
"Возможность применения налогоплательщиком специального налогового режима НПД не ставится в зависимость от наличия или отсутствия у налогоплательщика статуса налогового резидента Российской Федерации."
По общему правилу срок не прерывается. За основу берется отрезок в 12 месяцев подряд и если в нем Вы 183 календарных дня не в РФ, то Вы нерезидент.