Выделяет кератоконус тот факт, что в офтальмологическом сообществе активно ведутся дискуссии о причинах его развития. Недуг не имеет воспалительной природы, и большинство специалистов сходятся во мнении, что вызван он нарушением иммунных процессов организма. Среди других факторов выделяют травмы роговицы, нарушения в работе эндокринной системы, хронические заболевания (астма, аллергия), генетические заболевания.